Может ли физлицо учесть расходы при продаже помещения, часть которого использовалась в предпринимательской деятельности?

Добрый день.
Прошу совета по НДФЛ при продаже помещения, которое ЧАСТИЧНО  использовалось в предпринимательской деятельности.

У моего руководителя и его жены есть в собственности нежилое помещение (общая совместная собственность).
Приобретено в 2017 году, в браке.
Половину помещения руководитель от имени своего ИП сдает в аренду под офис (ИП на УСН 6%, есть все необходимые ОКВЭД - сдача в аренду, купля-продажа).
Сейчас они собираются продать помещение целиком, при этом 50% дохода планируют получить на ИП и заплатить 6%, а вторую часть задекларировать на жену (физ.лицо) и применить для расчета НДФЛ вычет по расходам на покупку этого помещения.
Конечно, вычет будет только на 50% от общей суммы расходов на приобретение. 

Мне кажется, есть риск, что налоговая может отказать жене руководителя в вычете, раз помещение "засветилось" в предпринимательской деятельности, хоть и частично.

В итоге вопрос такой: может ли в данной ситуации физлицо для расчета НДФЛ уменьшить свои 50% дохода на половину расходов или есть риски?
Заранее большое спасибо за ответы.